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Fundamentos da Ciência da Computação, Ciências Computacionais da Vida e Bioinformática



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Fundamentos da Ciência da Computação – O básico

  • Primeiros computadores e teoria algorítmica (30-50): Desenvolvimentos teóricos (por exemplo, máquina de Turing) e hardware primitivo definem o espaço a explorar, formalizando o que é computável e a complexidade da execução.
  • Linguagens de programação (50 anos ou mais): Desde linguagens assembly até ferramentas de alto nível (FORTRAN, COBOL e muitas outras), explora-se a criação de algoritmos capazes de “escrever outros algoritmos” com maior legibilidade humana.
  • Bases de Dar e Redes (60+): A necessidade de armazenar e transmitir de forma sistemática e eficiente dar, leva ao desenvolvimento de sistemas básicos dar e a infra-estrutura básica para Internet.

Nascimento e evolução das Ciências da Vida Computacionais e da Bioinformática

  • Biologia Molecular e Sequenciamento (50 anos ou mais): A descodificação da estrutura da vida a nível molecular (descobertas sobre ADN, ARN, proteínas...) requer técnicas cada vez mais avançadas para arquivar e analisar esta informação.
  • Projeto Genoma Humano (1990-2003): Esforço colaborativo em grande escala para obter a sequência completa do DNA humano. A gestão destes vastos dar é um avanço no uso da computação para aplicações em ciências biológicas.
  • A explosão “ômica” (2000+): Além do genoma, as proteínas (proteômica) e a transcrição (transcriptômica) são agora estudadas em larga escala. Algoritmos são especializados na análise de dar computação biológica e de alto desempenho.
  • Biologia de Sistemas Computacionais (anos 2000+): As tentativas de modelar processos biológicos em vários níveis com ferramentas computacionais (por exemplo, desde interações entre células até a simulação de órgãos ou organismos inteiros) estão se tornando um campo interdisciplinar crescente.

Simbiose: tecnologia da informação acelerando a biologia e vice-versa

  • Algoritmos bioinspirados: A natureza muitas vezes contém métodos eficientes para resolver problemas complexos. Isto estimula novas classes de algoritmos (por exemplo, redes neurais inspiradas no cérebro, evolução artificial que encontra analogias em mutações).
  • Problemas computacionalmente difíceis (difíceis): Muitas tarefas importantes em biologia (por exemplo, dobramento de proteínas, alinhamentos de sequências, etc.) são problemas “intrinsecamente” altamente complexos do ponto de vista computacional, o que ultrapassa os limites na criação de ferramentas de TI e no uso de recursos de supercomputadores.
  • Medicina personalizada e “Data Driven Discovery”: As técnicas de bioinformática e a análise de grandes conjuntos de dados genéticos (de indivíduos e da população em geral) oferecem oportunidades extraordinárias no diagnóstico, prevenção e tratamento de precisão.

Desafios e Futuro

  • Big Data e Na nuvem Informática: O volume de dar no campo biológico continua a crescer exponencialmente. São necessárias estratégias eficientes para processar e extrair informações relevantes de dilúvios de dados.
  • Interpretabilidade dos modelos: Abordagens como a aprendizagem profunda produzem frequentemente resultados altamente precisos, mas a sua interpretação pode ser difícil. É necessária uma melhor compreensão de “por que” eles funcionam, especialmente em áreas sensíveis como a medicina.
  • Privacidade e Ética: Como a massa de dar os dados pessoais com perfil genómico continuam a crescer, é imperativo garantir elevados padrões de privacidade, não discriminação e a sua utilização para investigação biomédica de forma totalmente consciente e transparente.

conclusão

Os Fundamentos da Ciência da Computação fornecem as ferramentas que permitem inovações revolucionárias em Ciências da Vida Computacionais e Bioinformática. Os problemas biológicos, por sua vez, oferecem desafios que avançam ainda mais no campo da computação. É uma verdadeira colaboração para compreender e potencialmente melhorar a própria vida.


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